基于分子對接及分子動力學模擬的中藥來源 II 型 5α-還原酶抑制劑篩選

摘 要： 目的 基于分子對接及分子動力學模擬方法從中藥活性成分中尋找潛在的 II 型 5α-還原酶（ 5αR2） 抑制劑。
方法 采用分子對接方法對中藥來源的 26 種單體成分進行對接，根據對接結果，對與蛋白結合較強的化合物進行分子
動力學模擬，采用 MM/PBSA 方法計算體系的結合自由能；通過體外微量酶反應體系進行生物活性驗證。 結果 26
種單體成分與 5αR2具有不同程度的結合能，其中女貞苷、紅花黃色素和扁柏雙黃酮的結合能較低，結合能力強；分
子動力學模擬結果與對接結果相一致（結合能力：女貞苷-蛋白＞紅花黃色素-蛋白＞扁柏雙黃酮-蛋白）；活性實驗結
果顯示 3 種成分對 5αR2 具有一定的抑制作用，女貞苷半數抑制濃度（ IC50）值為（ 42.12± 3.83） μmol/L，紅
黃黃色素 IC50 值為（ 69.06± 6.35） μmol/L，扁柏雙黃酮 IC50 值為（ 191.28± 5.90） μmol/L。 結論 篩選的
26 個單體成分中，女貞苷、紅花黃色素和扁柏雙黃酮具有預防和治療雄激素依賴型疾病新藥研發的潛力，為探索新
型 5αR2 抑制劑提供參考。
關鍵詞： II 型 5α-還原酶；分子對接；分子動力學模擬；中藥活性成分；女貞苷；紅花黃色素；扁柏雙黃酮
中圖分類號： R285.5 文獻標志碼： A 文章編號： 0253 - 2670(2020)10 - 2819 - 09
DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.10.024

1 材料
1.1 儀器
LC-20A 高效液相色譜儀（日本島津公司）；色
譜柱[COSMOSIL 5C18-MS-II 柱（ 250 mm× 2.6 mm，
5 μm）]； TGL-16 型高速低溫離心機（湖南湘儀實
驗室儀器開發有限公司）； SB-1200 型恒溫水浴鍋
（上海愛朗儀儀器有限公司）。
1.2 藥品與試劑
紅花黃色素（質量分數 98%， 批號 AF8030707），
成都埃法生物科技有限公司；扁柏雙黃酮（質量分